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科普講堂|實(shí)時熒光定量PCR檢測方法

更新時間:2023-01-03瀏覽:2368次

   聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制技術,PCR的最大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加勇探新路。目前體系,PCR成為分子生物學(xué)研究的一部分講道理。實(shí)時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技術(shù)技術節能,是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)增多,利用熒光信號積累實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程共創美好,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對模板進(jìn)行定量分析的方法。該項技術(shù)可以對DNA不斷完善、RNA樣品進(jìn)行相對定量數字化、絕對定量和定性分析,提高了普通PCR技術(shù)的特異性和準(zhǔn)確性基礎上,被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究各領域、疾病診斷、農(nóng)業(yè)檢測和法醫(yī)調(diào)查等領(lǐng)域保持競爭優勢。

  一進行培訓、常規(guī)PCR
  利用DNA分子會在體外95°高溫時會發(fā)生變性解旋變成單鏈,然后降溫到60°C左右時引物會與單鏈DNA按堿基互補(bǔ)配對原則結(jié)合,接著再升高溫度到72°C左右法治力量,即DNA聚合酶最適反應(yīng)溫度全技術方案,DNA聚合酶會沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成相應(yīng)的互補(bǔ)鏈,如此循環(huán)往復(fù)以達(dá)到DNA分子擴(kuò)增的目的共享,常規(guī)PCR技術(shù)無法實(shí)現(xiàn)精確定量信息化。
  二、實(shí)時熒光定量PCR
  如要對DNA全面闡釋、RNA樣品進(jìn)行精確定量研究創造,就需要采用實(shí)時熒光定量PCR,根據(jù)檢測實(shí)時熒光PCR產(chǎn)物的方式不同貢獻法治,實(shí)時熒光定量PCR主要有DNA結(jié)合染料法、基于探針的化學(xué)法發展需要、淬滅染料引物法等類型攻堅克難。
  1.DNA結(jié)合染料法
  原理:應(yīng)用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測PCR過程中積累的擴(kuò)增產(chǎn)物顯示。
  應(yīng)用于核算定量和基因表達(dá)驗證雙向互動。
  優(yōu)缺點(diǎn):它們的優(yōu)點(diǎn)是可以對任何雙鏈DNA進(jìn)行定量,不需要探針設計能力,具有相對高的靈敏度和可靠性品牌,并且成本低,簡單易用更為一致,缺點(diǎn)是它們能在反應(yīng)中結(jié)合所有的DNA雙鏈等形式,其中包括在PCR過程中產(chǎn)生的引物二聚體或其他非特異產(chǎn)物。
  染料法一般使用的是SYBR Green I染料研究與應用,這是一種可以與雙鏈DNA小溝結(jié)合的熒光染料飛躍,不會與單鏈DNA結(jié)合,并且在游離狀態(tài)下幾乎無熒光全面協議,只有與雙鏈DNA結(jié)合才會發(fā)出熒光重要部署,因此將PCR擴(kuò)增產(chǎn)生的雙鏈DNA數(shù)量與熒光強(qiáng)度直接關(guān)聯(lián),產(chǎn)生實(shí)時監(jiān)測的效果工具。
  2.基于探針的化學(xué)法
  原理:應(yīng)用一個或多個熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物智慧與合力;依賴熒光能量共振傳遞檢測特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。
  應(yīng)用于核酸定量重要的角色、基因表達(dá)驗證開放要求、等位基因鑒別、SNP分型優勢領先、病原體和病毒檢測迎來新的篇章、多重PCR。
  優(yōu)缺點(diǎn):探針法的鑒別能力遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于DNA結(jié)合染料法,因為它們只與目的產(chǎn)物結(jié)合薄弱點,從不與引物二聚體或其他非特異產(chǎn)物結(jié)合覆蓋範圍,缺點(diǎn)是它的合成價格高。
  探針法中常用的TaqMan探針是一種寡核苷酸探針積極性,熒光基團(tuán)連接在探針的5’末端又進了一步,而淬滅基團(tuán)則在3’末端,PCR擴(kuò)增時在加入引物的同時加入探針多元化服務體系,探針完整時規劃,熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收,PCR擴(kuò)增時深度,5’→3’外切酶活性將探針酶切降解帶動擴大,使熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離,從而檢測器可以接收到熒光信號開拓創新。
  3.淬滅染料引物法
  原理:采用熒光標(biāo)記引物擴(kuò)增持續發展,從而使熒光標(biāo)記基團(tuán)直接摻入PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中,依賴熒光能量共振傳遞促進善治。
  應(yīng)用于核酸定量擴大、基因表達(dá)驗證、等位基因鑒別發揮效力、SNP分型新格局、病原體和病毒檢測、多重PCR
  優(yōu)缺點(diǎn):探針和目標(biāo)片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號安全鏈,因此減少了背景熒光和假陽性顯示,還可進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,缺點(diǎn)是原料成本價格高
  三處理方法、實(shí)時熒光PCR儀
  實(shí)時熒光PCR系統(tǒng)包括熱循環(huán)儀重要作用,用于熒光激發(fā)的光學(xué)系統(tǒng)以及用于收集熒光數(shù)據(jù)和管理分析的計算機(jī)軟件,數(shù)據(jù)通過實(shí)時分析軟件以圖表的形式顯示習慣。

 

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